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罗莎琳德·埃尔西·富兰克林(或译作罗莎琳·富兰克林,Rosalind Elsie Franklin, R.E. Franklin)是一位英国物理化学家与晶体学家。她所作念的说合,专注于DNA、病毒、煤炭与石墨等物资的结构。图片
Photo 51 x-ray diffraction image她所拍摄的DNA晶体衍射图片“相片51号”,以及对于此物资的干整个据,是詹姆斯·沃森与佛朗西斯·克里克解出DNA结构的一些印迹,沃森和克里克在他晶体相片基础上,攻坚克难,发现DNA结构。
1968年沃森出书了一册具争议性的书本《双螺旋》(The Double Helix),这本书中对于克里克之外的科学家多所月旦。其中将罗莎琳德·富兰克林(在书中以我方取的混名“Rosy”称号)描绘成一个“女学究”(bluestocking)型的女性,从来不精粹女性特色,不涂口红也不选藏衣服。何况算计富兰克林的家庭可能是一个厄运的家庭。同期沃森也误合计富兰克林是威尔金斯的下属,并形状她是个不对作的东说念主物。此外书中也形状富兰克林透顶反对双螺旋结构模子。自后沃森与克里克都坦承富兰克林的说合成果,是建构双螺旋结构的必要印迹。克里克在一篇挂牵DNA结构发现40周年的著述中说说念:“富兰克林的孝敬莫得受到豪阔的细目,她明晰的发达两种型态的DNA,何况定出A型DNA的密度、大小与对称性。”另外皮2003年,国王学院将新大楼定名为罗莎琳德-威尔金斯馆时,沃森在定名演说中说说念:“罗莎琳德的孝敬是咱们粗略有这项紧要发现的关节。”
Genoox公司图片
该公司于2014年树立,创举东说念主为现任CEO Amir Trabelsi及CTO Moshe Einhorn。Trabelsi默示,他们使用机器学习算法来分析忽视基因变异,展望个体因这些基因变异出现某种情景的概率,这么,医疗诊所就不错少花些时候和资产来进行基因筛查分析了。尽管下一代基因测序时刻不错在一天之内对通盘基因组进行测序,但现在这一时刻制备少数几所机构掌执,Genoox的创举东说念主们但愿他们的用具能成为病患照护的平素部分。Genoox是一家致力于匡助医疗东说念主士分析病患基因数据的初创企业,Genoox的平台现在粗略经管全基因组测序(WGS)数据和全外显子测序数据。对会诊遗传性基因疾病都特殊遑急。该公司还筹画劝诱干系用具,测试一个东说念主是否是某种遗传性基因疾病佩带者,进行产前查验以及对癌症进行基因测试。
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Franklin网站使用简介 https://franklin.genoox.com-FranklinbyGenoox图片
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SNP例子图片
1.进中计站首页,按照“example”教唆的治安,输入基因变异信息。举例:“Fig4:c.317A>G”。随后会出现一些对于变异位点的细节信息,如zygosity、phenotypes、patient ethnicity、consanguineous、Parent of origin、reported classification。这些信息可不填,胜仗参预搜索。
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2.参预搜索成果页面后,分为两个板块,左边为变异干系信息,右边为患者临床信息,输入干系信息后,不错在“Export Summary”中输出“XLS”治安的对于变异位点的纪念证实注解。网站会根据ACMG指南,自动对变异位点进行致病等第评价。
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如上图制服丝袜,网站对Fig4:c.317A>G位点评价为“vus”,并排举出该位点的干系致病性把柄等第
Population Data:使用的是gnomAD population databases
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In-silico Predictions:变异位点无益性展望,若是是错义突变同是评估是否会发生剪切变异。图片
在“Export Summary”中,会显现一些软件的变异位点无益性展望成果。
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网站还从其他方面提供把柄,如下:图片
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还不错手动添加把柄:举例右侧的病例信息添加为“de novo”,该变异就酿成了“Likely Pathogenic”。图片
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3.Variant Assessment:对变异位点各方面进行纪念
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4.Publications:检索出该变异位点及该基因的干系文件(可是针对Fig4:c.317A>G,并未显现笔者所发表的文件。注册用户后,在右侧栏,不错手动自行添加未检索出的文件,匡助全球查询)
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5.Gene Assessment:该基因的干系信息(基因变异位点的致病性散布,基因致病性)
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6.Associated Conditions:现在依然报说念的与该基因干系疾病
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CNV例子
进中计站首页,按照“example”教唆的治安,输入基因变异信息。举例:“del:chr22-22997582-23637176”。相同,网站会根据最新的CNV致病性评级的ACMG指南,自动对CNV进行致病等第评价+打分,CNV干系病例的检索(这点特殊友好)。
温习一下——奈何判断 CNV的致病性(ACMG/ClinGen 2020年指南)
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这个区域的判断与咱们东说念主工查文件较为接近,this CNV interval region contained the distal type II (E–F) region (chr22:23,119,414–23,649,111), and overlapped with thedistal type I (D–E/F) region (chr22:21,917,117–23,649,111)。咱们的判断该CNV为临床趣味未明。
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提供了P/LP的病例
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同期提供了B/BL病例
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